iRepertoire 的免疫测序服务
免疫组库测序:RepSeq 和 RepSeq+
iRepertoire 的测序服务RepSeq和RepSeq+分别补充了我们的扩增技术arm-PCR和dam-PCR。由于 arm-PCR 和 dam-PCR 具有不同的优势,因此是否使用 RepSeq 或 RepSeq+ 将取决于您的具体项目的性质。
Arm-PCR使用内部和外部嵌套引物进行极其全面的库测序;因此,RepSeq 更适合发现低频克隆型,尤其是在细胞数量较少的情况下。arm-PCR 工作流程不太复杂,因此 arm-PCR 可以在内部使用标准实验室设备进行,而 dam-PCR 必须由 iRepertoire 完成。有关 arm-PCR 产品的更多信息,请参阅我们的产品页面。
RepSeq+以前所未有的多路复用能力提供了整个免疫组库的更定量图像。RepSeq+ 是唯一允许同时扩增和测序所有 7 条 TCR 和 BCR 链的平台。此外,由于 dam-PCR 中可以使用唯一的分子标识符,RepSeq+ 可以更灵敏地检测和纠正 PCR 和测序错误。当需要以高保真度识别单核苷酸变异性时,如在 B 细胞受体超突变分析中,RepSeq+ 是更好的选择。有关内部处理 RepSeq+ 样本,请参阅我们的全自动 iR-Flex 系统。
有关 arm-PCR 和 dam-PCR 的更多信息,请参阅我们的扩增技术帖子。
批量排序
iRepertoire 的扩增技术和测序服务旨在与多路复用兼容,因此您可以通过将多个样本批量处理为一次测序运行来节省成本。如果您的订单量不足以填满整个流动槽,我们可以使用其他客户样本来填充剩余空间。
例如,假设您想使用我们的RepSeq 服务研究单个样本的 TCR alpha 和 TCR beta 库。这相当于两个条形码库,因为扩增需要两个独特的试剂系统(每条链一个)。测序最有可能在 Illumina MiSeq 上使用 V2-500 循环试剂盒进行,并且由于该试剂盒可以对多达 10 个样本进行测序,读取深度为每个样本 1 百万次读取,因此我们需要在您的测序运行中放置另外八个客户样本以完成流动槽。
样本较少(即未填满整个流动槽)可能意味着测序完成的时间会延长,因为需要填充剩余空间。或者,如果您有足够的库来填充整个测序通道,则不会发生这种延迟。如果您的库与其他客户的库复用,我们可以提供解复用的数据(而不是原始测序数据)。如果您仅用样本填充整个通道,则此限制不适用。
有关多路复用的更多信息,请参阅我们的汇集样本页面。
有关 iRepertoire 试剂的更多信息,请参阅学习中心有关引物系统的文章。